oflyhigh: Linux 下安装 R 扩展包

来自 oflyhigh | May 26, 2018

本文经作者 @oflyhigh授权转载(原文链接),略有改动。


运行脚本

昨天我摸索出来执行R脚本的命令为:

R --slave -f hello.R

今天发现原来有一个专门的指令做这个工作:

Rscript

比如对于上述命令,我们可以修改为:

Rscript hello.R

除此之外,我们还可以用-e来直接执行一些语句,比如:

Rscript -e "1+1"
Rscript -e 'print("Hello World");'
Rscript -e "print(\"Hello World\");"
Rscript -e "print(\"Hello World\");1+1;2+2"

安装软件包

在使用Python语言时,我们知道可以使用pip指令来安装所需的软件包,那么R语言环境下,我们如何安装呢?答案是在R环境的提示符下直接使用类似如下指令即可:

install.packages("example_package")

比如我想安装一个caTools的东西(我也不知道是啥),这样做就可以鸟:

install.packages("caTools")

注:我是在普通用户账户下执行的R,所以执行上述指令是会提示我:

Would you like to use a personal library instead? (y/n) y

也就是说数据包被安装的本地,如果想安装到全局,估摸应该用sudo R来启动R环境(我瞎猜的,本地安装挺好,就不去测试了)

加载安装好的软件包,使用类似如下指令即可:

library(caTools)

见识一下

尽管"Hello World!"已经超级强大了,但是还是想见识一下更加强大的功能,在R语言的维基百科页面有一个曼德勃罗集合(Mandelbrot set)的例子,略作修改拿来运行一下,长长见识。

#install.packages("caTools")  # install external package
library(caTools)             # external package providing write.gif function
jet.colors <- colorRampPalette(c("#00007F", "blue", "#007FFF", "cyan", "#7FFF7F",
                                 "yellow", "#FF7F00", "red", "#7F0000"))
dx <- 400                    # define width
dy <- 400                    # define height
C  <- complex(real = rep(seq(-2.2, 1.0, length.out = dx), each = dy),
              imag = rep(seq(-1.2, 1.2, length.out = dy), dx))
C <- matrix(C, dy, dx)       # reshape as square matrix of complex numbers
Z <- 0                       # initialize Z to zero
X <- array(0, c(dy, dx, 20)) # initialize output 3D array
for (k in 1:20) {            # loop with 20 iterations
  Z <- Z^2 + C               # the central difference equation
  X[, , k] <- exp(-abs(Z))   # capture results
}
write.gif(X, "Mandelbrot.gif", col = jet.colors, delay = 25)

Mandelbrot.gif

虽然不知道是什么鬼,但是很漂亮,不是吗?

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