来自 赵鹏 | January 26, 2019
又要从前一段时间讲的那门R 语言，开放科学与可重复性研究说起了。学生们在课上情绪高涨，认为学 R 的难度跟兴趣一样大，关键是对数据、代码、产品之间的协作关系不好把握。
图 1. 工作中的科研要素 (改自学 R)
于是我答应给他们写个包，主要是模板性质，一是把图上这些要素关系理顺，二是让新手快速上手 R markdown。rmd 包是前传，rosr 包是正传。
rosr 的 rosr_new() 函数会生成一个包含了图 1 各种要素的项目示例，并且自动编译出成品的文稿、幻灯片、海报等产品，让新手一下就尝到 R markdown 全家桶搭配可重复性研究的美味。只需更新数据和代码，所有产品里的内容就全部自动更新。
图 2. 一个 rosr 项目的内部关联。
其实主要就是相对路径和 knitr::opts_knit$set(root.dir) 的使用，没啥新鲜的。要说新鲜的，那就是公式的插入。
图 3. rosr 项目里的示例公式表
科研项目里经常在各处插入同一公式，这个跟参考文献类似。所以，我仿照了 bibtex 的方式，把所有公式写在同一个 .Rmd 文件里，并自动编译成一个 html 文件。每个公式有个唯一的标签，相当于 bib 里的 entry。在文档里插入时，只需用 rosr::eq()函数指定公式标签就行了。
未来希望将 citr 插件+bookdown的公式插件结合起来，在小窗口里输入公式关键词，就跳出编译好的公式，鼠标选择就可插入。然而插件这块我不熟，要是有人愿意加入合作就太好了。我觉得把上述两个插件的源代码揉在一起就差不多了。
remotes::install_github('pzhaonet/rosr')
rosr::create_rosr('tesst')
其实，在应用层面上，即使不懂 R 语言，来尝尝 R markdown 全家桶的味道也不错。于是，我做了个 shiny 界面来创建项目，并做成了 RStudio 的插件，非 R 用户也可以用了。点击 RStudio 的 'Addins' 按钮，找到 "Create a rosr project"，点击。
会跳出一个窗口，用户只需点点点点，然后 Create 就可以看产品了。
rosr 的广告词：忘掉 R，拥抱 R Markdown。